Специалисты большое внимание уделяют рациональному использованию природных ресурсов, что позволяет ежегодно уменьшать количество потребления речной воды и сохранять благоприятный экологический баланс на территории присутствия ТЭЦ. С этой целью в устье водоприемного ковша водозабора предприятия установлено рыбозащитное сооружение «ПИРС». Оно представляет собой систему электродов, создающих в воде электрический импульс. Благодаря «ПИРСу» чувствительная к колебаниям электромагнитного поля рыбная молодь ,в случае приближения к месту работы циркуляционных насосов, меняет направление движения и отплывает на безопасное расстояние.
А вот о том, насколько гармонично удается мощнейшему энергетическому предприятию сосуществовать с окружающей экосистемой, говорит факт постоянного присутствия в границах водозабора Бийской ТЭЦ бобров и ондатр. Энергетики не скрывают, что иногда представители местной фауны добавляют забот, намереваясь разместить свои жилища в непосредственной близости к водозабоному ковшу. Однако никакого вреда производственной деятельности животные не наносят, а их спокойное пребывание в непосредственной близости к ТЭЦ только подтверждает отсутствие вредных для экологии факторов.
Ежегодно на водозаборе станции реализуется комплекс ремонтных мероприятий. Специалисты проводят диагностику и профилактическое обслуживание оборудования всей системы технического водоснабжения Бийской ТЭЦ.
В настоящее время здесь идет работа по ремонту вращающихся сеток, задерживающих мелкий и крупный мусор при закачке воды. Ведется подготовка к капитальному ремонту циркуляционного насоса №4, где планируется замена вала и элементов уплотнений. В этом году уже отремонтированы три циркуляционных, два дренажных и все вакуумные насосы.